An der Spitze der Verwaltung des Landkreises steht Landrat Markus Möller. Diese Position hat er nach Wahl durch den Kreistag am 4. April 2025 und seit 1. Juli 2025 inne. Er ist zugleich Vorsitzender des Kreistags sowie Vorsitzender des Verwaltungsrats, des Kreditausschusses und der Stiftungsräte der Kreissparkasse Göppingen. In Personalunion leitet er das Dezernat 1 der Landkreisverwaltung. Als Landrat ist er Vorsitzender der Aufsichtsräte des ALB-FILS-KLINIKUMS, der Wirtschafts- und Innovationsförderungsgesellschaft für den Landkreis Göppingen mbH/WIF sowie der Kreisbaugesellschaft mbH Filstal. In der Trägerversammlung der Gemeinsamen Einrichtung Jobcenter Landkreis Göppingen ist er ebenfalls Vorsitzender.

Allgemeiner Stellvertreter des Landrats ist der Erste Landesbeamte Jochen Heinz. Als Dezernent ist er zuständig für die Bereiche Bauen, Umweltschutz, Vermessung und Flurneuordnung sowie Forst-, Landwirtschaftsverwaltung und Abfallwirtschaft.